1979年9月为了将我国从事电子显微镜研究、生产、应用的各方面力量组织起来，使电子显微技术在四化建设中发挥更大作用，由钱临照等31位发起人向中国科学技术协会提出《申请成立中国电子显微镜学会的报告》。发起人为：钱临照、柯俊、郭可信、施履吉、邹承鲁、黄兰友、何寿安、李林、彭加木、姚骏恩、叶容、朱键、陈德昌、林卓然、吴惕生、冯端、西门纪业、陈尔纲、周文、丁树森、赵卓雍、韩荫志、林述明、尤宗杓、洪涛、解云、朱祖福、沈鸿根、张宜、张少卿和谢玉发。经多方协商由中国物理学会批准，成立本学会，作为中国物理学会的一个分会（对外为中国电子显微镜学会Chinese Electron Microscopy Society）。

1980年11月1～5日在成都市召开了中国电子显微镜学会成立大会，同时举行首次全国电子显微学学术交流会。中国物理学会副理事长甘柏出席讲话。柯俊代表筹委会作筹备工作报告。大会的《论文报告摘要汇编》共发表论文报告393篇。分为《综合、仪器》，《生物、医学》，《金属、材料、地质、化工、半导体》三个分册。有233个单位的286名代表出席。会议期间，国际电子显微镜学会联合会秘书长托马斯（G. Thomas）教授、日本电子显微镜学会前会长、国际电子显微镜学会联合会执行委员桥本初次郎到会祝贺，并作了特邀学术报告。

至今，中国电子显微镜学会走过了四十个春秋，从当初的个位数电镜发展到现在上万台电子显微镜，包括200余台居国际前沿的球差校正透射电子显微镜，高端显微学硬件设备拥有量走入世界前列。其产生的巨大影响已经从学术论文主战场发展到支撑国家重大需求，系统性解决相关领域重大和关键科学问题与难题，包括航空航天、信息科学与技术、生命药物、化学化工等前沿学科领域。长江后浪推前浪，非常欣喜看到年轻一代的高水平快速成长和活跃于科学前沿！祝愿中国电子显微镜学会为科技创新强国，中华民族的伟大复兴再做贡献！